WS9-1Back
多様なRNAウイルス同定を目指したNeoRdRpデータベースの構築
中川草[1], 坂口翔一[2], 浦山俊一[3], 高木善弘[4], 布浦拓郎[5]
[1]東海大・医・分子生命, [2]大阪医薬大・医・微生物, [3]筑波大・生命環境, [4]JAMSTEC・超先鋭研究開発, [5]JAMSTEC・生命理工

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大規模RNAシークエンスデータからの新規RNAウイルスの発見が相次いでいる。そのような研究を発展させるため、本研究ではRNAウイルスに特有のRNA依存性RNAポリメラーゼ（RdRp）を大規模に収集し、RdRpの隠れマルコフモデル（HMM）データベースNeoRdRpを構築した（https://github.com/shoichisakaguchi/NeoRdRp）。NeoRdRpでは1,182のHMMプロファイル、12,502アミノ酸配列、そして本HMMプロファイルを構築した解析パイプラインも公開している。本ワークショップではNeoRdRpの性質と今後に開発について議論する。
keywords: RNAウイルス;データベース;メタゲノム

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NeoRdRp: A Comprehensive Dataset for Identifying RNA-dependent RNA Polymerases of Various RNA Viruses
So Nakagawa [1], Shoichi Sakaguchi [2], Syun-ichi Urayama [3], Toshihiro Takaki [4], Takuro Nunoura [5]
[1] Dep Mol Life Biol, Tokai Univ. Sch of Med,[2] Dep Microbiol, Osaka Med Pharm Univ,[3] Dep Life Environ Sci, Univ. Tsukuba,[4] SUGAR, JAMSTEC,[5] CeBN, JAMSTEC