WS2-3†Back
大腸菌をゲノム配列からまるごとモデリングする
*海津一成[1], Eliott Jacopin[2], 高橋恒一[1]
[1]理研・BDR, [2]阪大・生命機能
大腸菌は最も良く研究されたモデル生物の一つである。しかし、我々はその大腸菌という生命システムをどの程度理解できたと言えるのだろうか？我々は大腸菌を遺伝子発現・代謝・ゲノム複製などの細胞機能から1細胞まるごとモデリングする技術を開発している。さらに本研究では、複数の配列解析技術と各種データベースを活用し、ゲノム配列から直接自動で細胞モデルを構築する。これにより、数理的なモデルの詳細を知らなくても、ゲノム配列を入力するだけで1細胞・全ゲノム規模のオミクスデータなどの表現型を計算機上で評価できる。最後に本発表では、この全細胞モデリング技術を利用した合成ゲノムの「仮想」実験の例も紹介する。
keywords: Bacteria; Systems Biology; Simulation
Whole-cell modeling of Escherichia coli from its genome sequence
*Kazunari Kaizu [1], Eliott Jacopin [2], Koichi Takahashi [1]
[1] BDR, RIKEN[2] FBS, Osaka Univ.