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オミックスデータを用いたde novo gene birthメカニズムの探索
*細川竜聡[1], 里村和浩[2], 長田直樹[1], 遠藤俊徳[1]
[1]北海道大・情, [2]長浜バイオ大学・バイオサイエンス学部
遺伝子がどのようにして生まれるのかを理解することは、進化遺伝学的に重要である。近年、新規遺伝子が非遺伝子領域から誕生するde novo gene birthが報告されているが、そのメカニズムについては複数の仮説が提唱されている。本研究では、データベースに依存した先行研究の問題点に着目し、より正確なde novo geneの特定やメカニズムの探索を目的とした。そこで、ゲノム・トランスクリプトーム・プロテオームのそれぞれの階層の相互比較解析を行なった。材料として、95%以上の遺伝子がシングルエキソンであるという利点がある出芽酵母を用いた。
keywords: 出芽酵母; de novo gene; ORF
Exploring de novo gene birth mechanism using omics data
*Ryuto Hosokawa[1], Kazuhiro Satomura[2], Naoki Osada[1], Toshinori Endo[1]
[1] Info. Sci., Hokkaido Univ., [2] Science, Nagahama Institute of Bioscience and Technology