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シロイヌナズナの新規染色体部分的重複変異体における遺伝子発現変動とクロマチン動態
*杉田和陽 [1], サンジャヤアルビン [1], 西嶋遼 [1], 田中裕之 [2], 伊藤武彦[2], 村井耕二 [1], 阿部知子 [3], 風間裕介 [1], [3]
[1]福井県大・生物資源, [2]東工大・生命理工学院, [3]理研・仁科センター

逆位や転座、重複などは、生物の種分化、適応、及び進化に関与すると考えられているが、再編成が生じた直後のゲノムへの影響を精査した例は少ない。我々は、シロイヌナズナに重イオンビーム照射し、２番染色体と４番染色体に逆位及び重複をもつAr55 as5を作出した。Ar55 as5変異体では花成が10日ほど遅れ、草丈が15 cmほど長くなっていた。RNA-Seqの解析により、全検出遺伝子18868のうち649遺伝子の発現量が有意に上昇し、そのうち241遺伝子は重複部位に座乗していた。ChIP-Seqの結果、この重複部位ではH3K4me3のシグナルが蓄積していた。以上より、染色体再編成で新規に生じた重複部位ではクロマチンが緩んだ状態にあり、遺伝子発現量が上昇していることが示唆された。
keywords: シロイヌナズナ; 染色体再編成; 遺伝子発現変動

Gene expression changes and chromatin dynamics in a novel partial chromosome duplication mutant of Arabidopsis thaliana
*Kazuhiro Sugita [1], Alvin Sanjaya [1], Ryo Nishijima [1], Hiroyuki Tanaka [2], Takehiko Itoh [2], Kouji Murai [1], Tomoko Abe [3], Yusuke Kazama [1], [3]
[1] Dep. Biosci. Biotech., Fukui Pref. Univ., [2] School Life Sci.Tech., Tokyo Tech., [3] RIKEN Nishina Center.