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マウスゲノムにおいて遺伝子は無いのに遺伝子トラップクローンが集積している領域（TCAA）の機能解析
*荒木 正健[1], 池田 琉那[1], 齋藤 桂花[1], 久場 兼裕[1], 北元 優梨[1], 吉信 公美子[1], 山根 万里子[2,3], 丹羽 仁史[2], 荒木 喜美[1]
[1]熊本大学　生命資源研究・支援センター, [2]熊本大学　発生医学研究所, [3]東京医科歯科大学　難治疾患研究所

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我々はデータベースEGTCを公開している。遺伝子トラップクローン（TC）の解析を行う過程において、遺伝子は無いのにTCが集積している領域を発見した。このような領域をTCAA (Trap Clone Accumulated Area)と呼ぶことにする。UCSC Genome Browser (mm9)を用いて、各染色体のTCAAの探索を行った。その結果、マウス染色体全体で1108個のTCAAを同定した。TCAAの生理機能を推定するために、ES細胞におけるRNA-seq、ATAC-seq、及びOct4-ChIP-seqのデータを検討した。その結果、興味深い知見が得られたので報告する。
keywords: マウス；遺伝子トラップ；胚性幹細胞

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Functional analysis of TCAA (Trap Clone Accumulated Area).
*Masatake Araki[1], Runa Ikeda[1], Keika Saitou[1], Kanehiro Kuba[1], Yuri Kitamoto[1], Kumiko Yoshinobu[1], Mariko Yamane[2,3], Hitoshi Niwa[2], Kimi Araki[1]
[1] Inst. Resource Development and Analysis, Kumamoto Univ., [2] Inst. Molecular Embryology and Genetics, Kumamoto Univ., [3] Med. Res. Inst., Tokyo Med. Dental Univ.