2C-07Back
RAD-seqと全ゲノムデータに基づく広範な地域のヒョウタンの地理的分岐モデルを推定する集団遺伝解析
*渡部大[1], 長田直樹[1], 湯浅浩史[2], 遠藤俊徳[1]
[1]北大・情, [2]進化生物学研究所
ヒョウタンの集団ゲノム解析は、コーカサスや地中海など東アジア・アフリカ地域外を対象とした系統解析は今のところされていない。本研究においては、32カ国のサンプルを用いて、RAD-seqとwhole genome dataに基づいた解析を行った。結果として、Neighbour-Net treeは東/東南アジアとアフリカを両端に形成し、アジア寄りの中間付近から中央アジア、地中海、コーカサス、中米地域のサンプルの枝が分岐した。このことから、ヒョウタンが東/東南アジアに到達する途中でこれらの地域で拡散し分岐した可能性を示した。またこの結果はPCAの結果と一致した。
keywords: ヒョウタン 集団遺伝
Population genetic analysis to estimate a genetic divergence model for the L. siceraria to reach the Asian region
*Dai Watabe[1]、Naoki Osada[1]、Hiroshi Yuasa[2]、Toshinori Endo[1]
[1]Info. Sci., Hokkaido Univ. [2]Evol Bio.