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縮約ゲノム解析による日本産モグラ類(Mogera imaizumii, Mogera wogura)の系統地理学的解析
*角井建[1], 木下豪太[2], 原田正史[3], 佐藤淳[4], 郷康広[5], 辰本将司[5], 三橋れい子[3] 鈴木仁[6], 長田直樹[1]
[1]北大院・情報科学, [2]国立遺伝学研究所, [3]所属なし, [4]福山大・生物工学科, [5]自然研・生命創成センター, [6]北大・低温研
日本列島に広く生息する地下性モグラ類の分散様式は地形や植生に強く依存する。その集団構造の歴史の解明は日本列島の生物相が過去の気候変動から受けた影響の解明にも繋がると考えられる。本研究では、アズマモグラ(Mogera imaizumii)90個体とコウベモグラ(Mogera wogura)87個体を用い、MIG-seqによって得られたSNPデータを使用して二種のモグラ類の集団構造を解析し、それぞれ4/5個の分集団を検出した。モグラ類の集団構造や歴史的集団動態について、第四期における環境変動の影響を踏まえ、ミトコンドリアDNAや核遺伝子を用いた先行研究と比べて論じる。現在、10x Linked ReadとOmni-Cによる全ゲノム配列の決定を進めており、それを用いたより精度の高い解析をおこなう計画である。
keywords: 系統地理;第四紀;哺乳類
Phylogeographic analyses on Japanese moles (Mogera imaizumii, M. wogura) based on next-generation sequencing
*Takeru Tsunoi [1], Gohta Kinoshita [2], Masashi Harada [3], Jun Sato [4], Yasuhiro Go [5], Tatsumoto Shoji [5], Reiko Mitsuhashi [3], Hitoshi Suzuki [6], Naoki Osada [1]
[1] Info. Sci. Tech, Hokkaido Uni., [2] National Institute of Genetics, [3] No affiliation, [4] Biotech., Fukuyama Uni., [5] ExCELLS, National Institutes of Natural Sciences, [6] Institute of Low Temperature Science, Hokkaido Uni.